當下，國防部長里昂忙飛快地按下電話號碼，接通了白宮的內线電話。
總算接通了電話，當國防部長里昂將這邊的情況報告給米國總統奧黑馬以後，本來想將衛星截圖影像傳送過去，可奇怪的是，那一段古怪圓球摧毀“希柯馬”星人太空母艦和整支反重力飛機碟戰斗群的影像視頻，竟然完全消失了，變得一片空白，就仿佛從沒出現過一般。
這個意外的結果，讓國防部長里昂和一眾軍官目瞪口呆，也讓米國總統奧黑馬感到驚疑不定，若不是國防部長里昂口口聲聲地向他保證，這件事情是真實的，並且還拿他自己的腦袋擔保，恐怕奧黑馬會撤了他的職！
就在國防部長里昂和米國總統奧黑馬一眾感到頭暈腦亂之時，屏幕上又出現了另外一幕情景。
只見漂浮在海面上那個古怪的金屬大圓球，突然飛快地旋轉了一下，然後從球體的一側，突然出現了一道類似艙門的東西，一艘人類的阿爾文微型潛水艇，從那艙口處位置“彈”了出來，落到了海面上。
然後，那個古怪的金屬大圓球，再度從海面上一旋轉，關閉了艙門，然後迅速往深海中潛了下去，轉眼之間，只遺留下一個盤旋的旋渦，並慢慢消失掉了…
與此同時，海面上那艘被“彈”出來的阿爾文微型潛水艇，頂上的艙門被推了開來，從里面爬出了兩個人來。
其中一個，正是米國海軍陸戰隊的，另外一個，則是那名中年海軍軍官！
兩人爬出潛水艇以後，抬頭怔怔地望著從天空中劃落下，如同煙花飛散一般的太空母艦碎片殘骸，一言不發，眸子里卻閃爍著無比興奮和難以相信的目光。
“噢！天啊…那是“尼米茲”號的傑森艦長！！他，他怎麼會在那里？他旁邊那家伙是誰？”
國防部長里昂突然認出了那名海軍軍官，當下無比驚訝地叫了起來。
而凱斯上士和傑森艦長並不知道他們已經成了萬眾矚目的人，依然出神地仰望天空，心情久久不能平靜下來…
因為，之前他們駕著阿爾文微型潛水艇，一路將雲龍送到了海底深處的某個位置以後，雲龍竟然要求停了下來。
然後，雲龍換上深海潛水服，進入了底艙的eve發射艙里，要求傑森艦長將那台eve潛水器發射出去。
（注：eve潛水器，一種先進的水下潛行裝置，米國海軍特種部隊才有列裝，在游戲使命召喚中出現過。）
傑森艦長雖然不知道雲龍想要干什麼，但是他依然按照他的要求，將eve發射艙發射了出去。
而雲龍便隨著那台eve發射艙，迅速消失在了黑暗的深海之中。
在等候了大約半個多鍾頭之後，突然一個巨大的圓球狀金屬物體迅速向阿爾文微型潛水艇靠近過來，並突然將之“吞沒”了進去。
正當凱斯上士和傑森艦長驚魂未定時，頭頂卻傳來了雲龍的聲音：“兩位，這東西就是拿來對付外星人的武器，自動攻擊程序已經設定好，你們只需要坐穩，然後看熱鬧就可以了！”
說完，雲龍的聲音就消失了，然後，接下來發生的一切，就是前面那匪夷所思的一幕…
而對於海上和陸地發生的一切，似乎已經跟雲龍無關了，因為這個時候，他已經在“罪惡火花”的引導之下，進入了隱藏在聖莫尼卡灣深海的岩石深層中，那上古“先驅”遺留下來的遺跡之中。
根據“罪惡火花”的指引，雲龍必須要從潛到這里的海底，啟動“超重力光子傳輸器”，才能夠進入先驅遺留在地殼深處的“聖堂”，進行第三階段的基因強化工程！
在啟動“超重力光子傳輸器”以後，雲龍按照“罪惡火花”的提示，進入了那閃爍著綠光的重力艙內。
當重力艙一關閉起來以後，雲龍登時覺得，四周圍的空氣，突然變成了巨大的壓力，如同一座小山一般，重重地壓在了自己的身體上！
這突如其來的重壓，差點就讓雲龍喘不過氣來，他全身的肌肉已經全部繃緊，就連骨骼亦被壓得咯咯作響，同時他不得不張大了嘴巴拼命呼吸著，這種難以忍受的超級重力，讓他感到十分痛苦。
這時“罪惡火花”提醒他道：“主人，您忍一忍吧！這是高達100g的超重力，想要進入先驅的聖堂，必須先通過超重力的的考驗，才能夠將您的身體狀態，調整到能夠適應三階段的基因強化的程度！”
“哦！我忍！我忍！”
雲龍總算明白過來，為什麼自己必須要經歷不同階段的基因強化工程，如果沒有之前的階段，自己的身體根本承受不了這高達100g的恐怖重力。
要知道，即使是最優秀的人類戰斗機飛行員，在經過長時間的艱苦訓練以後，最多只能夠承受8—15g的重力，而雲龍卻要支撐100g的重力，這幾乎是將上萬kg的重量壓在他的身體上！
也不知道時間過了多久，當雲龍被這恐怖的超重力壓得快要窒息時，耳朵邊終於響起了“罪惡火花”的聲音：“好了！主人，超重力負荷已經過載完成，現在，我要啟動光子傳輸器了！你要准備好了！”
“嗯，我，我准備好了！“雲龍氣喘吁吁地應了一聲。
“那好！我啟動了！”
“罪惡火花”又說了一聲，雲龍只覺得在自己眼前迸發出一團耀眼的綠光，然後，更加可怕的重力再度壓擠到了自己身體上。
這一次，雲龍再也忍受不住了，直接悶哼一聲，很干脆地暈了過去…
而“罪惡火花”好象已經預料到會有這樣的結果，依然有條不紊地執行著程序。
很快，雲龍的身體被一團綠光包裹了起來，並迅速地被送如了一個開啟的綠色光環之中，然後，化為一蓬刺眼的綠芒，身體迅速拉長…
“蓬！”一聲，消失在了深海之中！